Han blev født i Pleß i Oberschlesien og tilbragte sin barndom i Breslau efter sin fars tidlige død i 1876, hvor han gik på Matthias-Gymnasium og begyndte at uddanne sig hos dekorationsmaleren Georg Heintze i 1886. Senere fortsatte han sin uddannelse på kunsthåndværkerskolen i Breslau og blev undervist af lærere som Heinrich Irmann, Paul Schobelt og Albrecht Bräuer.
I 1894 begyndte Münzer sine studier på kunstakademiet i München, hvor han blev undervist af anerkendte kunstnere som Karl Raupp og Otto Seitz. Under sin militærtjeneste kom han i malerklasse hos Paul Hoecker, som fokuserede intensivt på friluftsmaleri. Münzer fik endda sit eget mesteratelier her i 1896.
I 1898 var han en af to prisvindere i Ludwig Stollwercks første konkurrence om design til Stollwercks samlerbilleder med en præmiesum på 1000 mark. Fra 1899 udstillede Münzer sine værker i Münchens Glaspalast som medlem af kunstnergruppen Scholle. Det førte også til et samarbejde med Münchens ugemagasin “Jugend” og det satiriske magasin “Simplicissimus”.
Under et ophold i Paris fra 1900 til 1902 konsoliderede han sin kunstneriske udvikling. I 1903 mødte han Marie Therese Dreeßen, født von Vestenhof, som han giftede sig med et år efter en spektakulær skandale. Skandalen førte til skilsmisse mellem fru Dreeßen og hendes mand.
I 1909 blev Münzer leder af en malerklasse på kunstakademiet i Düsseldorf, hvor han underviste indtil 1932. I denne periode skabte han også vægmalerier og loftsmalerier til Düsseldorfs distriktsregering. Under Første Verdenskrig var han krigsmaler ved fronten i 1915 og meldte sig som frivillig i 1917, men kom ikke i aktion.
I 1938 flyttede familien Münzer til Holzhausen am Ammersee. Münzers værker blev udstillet på forskellige anerkendte museer og samlinger, herunder Neue Pinakothek i München, Wallraf-Richartz-Museum i Köln, Städtisches Kunstmuseum Düsseldorf og Kunstverein Basels samling.
Mellem 1938 og 1944 deltog Münzer aktivt i de store tyske kunstudstillinger, som nationalsocialisterne tog initiativ til i Haus der Deutschen Kunst i München, og han solgte endda et værk til Adolf Hitler. I 1950 udstillede han 30 malerier på Münchens kunstnerkooperativ. Münzer blev optaget på listen over dem, der blev hædret af Reichsministerium für Volksaufklärung und Propaganda i 1944.
Münzers fortællende stil var tydelig i hans grafik, især i hans eventyrillustrationer for Scholz-forlaget i Mainz. Han var også medlem af Deutscher Künstlerbund.
