Geboren in Pleß, Opper-Silezië, bracht hij na de vroege dood van zijn vader in 1876 zijn jeugd door in Breslau, waar hij naar het Matthias-Gymnasium ging en in 1886 een opleiding begon bij de decoratieschilder Georg Heintze. Later vervolgde hij zijn opleiding aan de Kunstnijverheidsschool in Breslau en kreeg les van leraren als Heinrich Irmann, Paul Schobelt en Albrecht Bräuer.
In 1894 begon Münzer zijn studie aan de Academie voor Schone Kunsten in München, waar hij les kreeg van beroemde kunstenaars als Karl Raupp en Otto Seitz. Tijdens zijn militaire dienst kwam hij terecht in de schilderklas van Paul Hoecker, die zich intensief richtte op het schilderen in de open lucht. Münzer kreeg hier in 1896 zelfs zijn eigen meesteratelier.
In 1898 was hij een van de twee prijswinnaars in de eerste wedstrijd van Ludwig Stollwerck voor ontwerpen voor verzamelaarsplaatjes van Stollwerck, met een prijzengeld van 1000 mark. Vanaf 1899 stelde Münzer zijn werk tentoon in het Glaspalast in München als lid van de kunstenaarsgroep Scholle. Dit leidde ook tot zijn samenwerking met het Münchense weekblad “Jugend” en het satirische tijdschrift “Simplicissimus”.
Tijdens een verblijf in Parijs van 1900 tot 1902 consolideerde hij zijn artistieke ontwikkeling. In 1903 ontmoette hij Marie Therese Dreeßen, née von Vestenhof, met wie hij een jaar na een spectaculair schandaal trouwde. Dit schandaal leidde tot de scheiding van mevrouw Dreeßen en haar man.
In 1909 werd Münzer hoofd van een schilderklas aan de Kunstacademie van Düsseldorf, waar hij tot 1932 lesgaf. In die tijd maakte hij ook muurschilderingen en plafondschilderingen voor het districtbestuur van Düsseldorf. Tijdens de Eerste Wereldoorlog diende hij als oorlogsschilder aan het front in 1915 en meldde zich vrijwillig in 1917, maar kwam niet in actie.
In 1938 verhuisde de familie Münzer naar Holzhausen am Ammersee. Münzers werken werden tentoongesteld in verschillende gerenommeerde musea en collecties, waaronder de Neue Pinakothek in München, het Wallraf-Richartz-Museum in Keulen, het Städtisches Kunstmuseum Düsseldorf en de collectie van het Kunstverein Basel.
Tussen 1938 en 1944 nam Münzer actief deel aan de Grote Duitse Kunsttentoonstellingen die op initiatief van de nationaalsocialisten in het Haus der Deutschen Kunst in München werden gehouden en hij verkocht zelfs een werk aan Adolf Hitler. In 1950 exposeerde hij dertig schilderijen bij de kunstenaarscoöperatie in München. Münzer stond op de erelijst van het Reichsministerium für Volksverlichtung und Propaganda in 1944.
Münzers verhalende stijl kwam duidelijk naar voren in zijn grafiek, vooral in zijn sprookjesillustraties voor de uitgeverij Scholz in Mainz. Hij was ook lid van de Deutscher Künstlerbund.
