Nascido em Pleß, na Alta Silésia, passou a infância em Breslau, após a morte prematura do pai em 1876, onde frequentou o Ginásio Matthias e começou a estudar com o pintor decorativo Georg Heintze em 1886. Mais tarde, continuou a sua formação na Escola de Artes e Ofícios de Breslau, tendo sido ensinado por professores como Heinrich Irmann, Paul Schobelt e Albrecht Bräuer.
Em 1894, Münzer iniciou os seus estudos na Academia de Belas Artes de Munique, onde foi ensinado por artistas de renome como Karl Raupp e Otto Seitz. Durante o serviço militar, junta-se à classe de pintura de Paul Hoecker, que se dedica intensivamente à pintura ao ar livre. Em 1896, Münzer recebeu aqui o seu próprio atelier.
Em 1898, foi um dos dois vencedores do primeiro concurso de Ludwig Stollwerck para desenhos de quadros de coleção Stollwerck, com um prémio monetário de 1000 marcos. A partir de 1899, Münzer expõe os seus trabalhos no Glaspalast de Munique, como membro do grupo de artistas Scholle. Isto levou-o também a colaborar com o semanário de Munique “Jugend” e com a revista satírica “Simplicissimus”.
Durante uma estadia em Paris, de 1900 a 1902, consolida o seu desenvolvimento artístico. Em 1903, conhece Marie Therese Dreeßen, nascida von Vestenhof, com quem se casa um ano depois de um escândalo espetacular. Este escândalo levou ao divórcio da Sra. Dreeßen e do seu marido.
Em 1909, Münzer tornou-se diretor de uma classe de pintura na Academia de Arte de Düsseldorf, onde leccionou até 1932. Durante este período, também criou murais e pinturas de teto para o governo do distrito de Düsseldorf. Durante a Primeira Guerra Mundial, serviu como pintor de guerra na frente de batalha em 1915 e foi voluntário em 1917, mas não chegou a entrar em ação.
Em 1938, a família Münzer mudou-se para Holzhausen am Ammersee. As obras de Münzer foram expostas em vários museus e colecções de renome, incluindo a Neue Pinakothek em Munique, o Wallraf-Richartz-Museum em Colónia, o Städtisches Kunstmuseum Düsseldorf e a coleção do Kunstverein Basel.
Entre 1938 e 1944, Münzer participou ativamente nas Grandes Exposições de Arte Alemã iniciadas pelos nacional-socialistas na Casa da Arte Alemã de Munique e chegou a vender uma obra a Adolf Hitler. Em 1950, expõe trinta quadros na Cooperativa de Artistas de Munique. Em 1944, Münzer foi incluído na lista dos homenageados pelo Ministério do Iluminismo Popular e da Propaganda do Reich.
O estilo narrativo de Münzer é evidente nos seus trabalhos gráficos, especialmente nas suas ilustrações de contos de fadas para a editora Scholz em Mainz. Foi também membro da Deutscher Künstlerbund.