Han föddes i Pleß i Oberschlesien och tillbringade sin barndom i Breslau efter faderns tidiga död 1876, där han gick på Matthias-Gymnasium och 1886 började utbilda sig hos dekorationsmålaren Georg Heintze. Han fortsatte senare sin utbildning vid School of Arts and Crafts i Breslau och undervisades av lärare som Heinrich Irmann, Paul Schobelt och Albrecht Bräuer.
År 1894 inledde Münzer sina studier vid konstakademin i München, där han undervisades av kända konstnärer som Karl Raupp och Otto Seitz. Under sin militärtjänstgöring gick han i målarklass hos Paul Hoecker, som fokuserade intensivt på friluftsmåleri. Münzer fick till och med sin egen ateljé här 1896.
År 1898 var han en av två pristagare i Ludwig Stollwercks första tävling om design för Stollwercks samlarbilder, med en prissumma på 1000 mark. Från 1899 ställde Münzer ut sina verk i Münchens Glaspalast som medlem av konstnärsgruppen Scholle. Detta ledde också till ett samarbete med Münchens veckotidning ”Jugend” och den satiriska tidskriften ”Simplicissimus”.
Under en vistelse i Paris 1900-1902 befäste han sin konstnärliga utveckling. År 1903 träffade han Marie Therese Dreeßen, född von Vestenhof, som han gifte sig med ett år efter en spektakulär skandal. Skandalen ledde till skilsmässa mellan fru Dreeßen och hennes man.
År 1909 blev Münzer chef för en målarklass vid Düsseldorfs konstakademi, där han undervisade fram till 1932. Under denna tid skapade han även vägg- och takmålningar för Düsseldorfs distriktsregering. Under första världskriget tjänstgjorde han som krigsmålare vid fronten 1915 och anmälde sig som frivillig 1917, men deltog inte i strid.
År 1938 flyttade familjen Münzer till Holzhausen am Ammersee. Münzers verk ställdes ut på flera kända museer och samlingar, bland annat Neue Pinakothek i München, Wallraf-Richartz-Museum i Köln, Städtisches Kunstmuseum Düsseldorf och Kunstverein Basels samling.
Mellan 1938 och 1944 deltog Münzer aktivt i de stora tyska konstutställningarna som nationalsocialisterna initierade på Haus der Deutschen Kunst i München och sålde till och med ett verk till Adolf Hitler. År 1950 ställde han ut trettio målningar på Münchens konstnärskooperativ. Münzer fanns med på listan över dem som hedrades av Reichsministerium für Volksaufklärung und Propaganda 1944.
Münzers berättande stil var tydlig i hans grafik, särskilt i hans sagoillustrationer för Scholz förlag i Mainz. Han var också medlem i Deutscher Künstlerbund.
