Народився в Плесі, Верхня Сілезія, але після ранньої смерті батька в 1876 році провів дитинство в Бреслау, де відвідував гімназію імені Матіаса, а в 1886 році почав навчатися у художника-декоратора Георга Хайнце. Пізніше він продовжив навчання у Школі мистецтв і ремесел у Бреслау, де його навчали такі викладачі, як Генріх Ірманн, Пауль Шобельт та Альбрехт Брауер.
У 1894 році Мюнцер розпочав навчання в Академії образотворчих мистецтв у Мюнхені, де його навчали такі відомі художники, як Карл Раупп та Отто Зайц. Під час військової служби він приєднався до класу живопису Пауля Геккера, який інтенсивно займався живописом на відкритому повітрі. У 1896 році Мюнцер навіть отримав тут власну майстерню.
У 1898 році він став одним із двох лауреатів першого конкурсу Людвіга Штольверка на оформлення колекційних картин Штольверка з призовим фондом у 1000 марок. З 1899 року Мюнцер виставляв свої роботи в мюнхенському Гласпаласті як член групи художників Шолле. Це також призвело до його співпраці з мюнхенським тижневиком “Jugend” та сатиричним журналом “Simplicissimus”.
Під час перебування в Парижі у 1900-1902 роках він закріпив свій мистецький розвиток. У 1903 році він познайомився з Марією Терезою Дріссен, уродженою фон Вестенгоф, з якою одружився через рік після гучного скандалу. Цей скандал призвів до розлучення пані Дріссен та її чоловіка.
У 1909 році Мюнцер очолив клас живопису в Дюссельдорфській академії мистецтв, де викладав до 1932 року. У цей час він також створював фрески та стінописи для районної адміністрації Дюссельдорфа. Під час Першої світової війни він служив військовим художником на фронті в 1915 році, а в 1917 році пішов добровольцем, але не бачив бойових дій.
У 1938 році родина Мюнцерів переїхала до Гольцгаузена на Аммерзее. Роботи Мюнцера виставлялися в різних відомих музеях і колекціях, зокрема в Новій Пінакотеці в Мюнхені, Музеї Вальрафа-Ріхарца в Кельні, Художньому музеї Дюссельдорфа та в колекції Базельського художнього союзу.
У 1938-1944 роках Мюнцер брав активну участь у Великих німецьких художніх виставках, ініційованих націонал-соціалістами в Будинку німецького мистецтва в Мюнхені, і навіть продав одну роботу Адольфу Гітлеру. У 1950 році він виставив тридцять картин у Мюнхенському кооперативі художників. У 1944 році Мюнцер був включений до списку почесних громадян Рейхсміністерства народної просвіти та пропаганди.
Оповідний стиль Мюнцера проявився в його графіці, зокрема в ілюстраціях до казок для видавництва Scholz у Майнці. Він також був членом Німецької спілки художників.
